Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPFP62306 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPFP62306 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms