Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2MP61081 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UBE2MP61081 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms