Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CABP4P57796 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CABP4P57796 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CABP4P57796 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CABP4P57796 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CABP4P57796 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CABP4P57796 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CABP4P57796 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CABP4P57796 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CABP4P57796 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CABP4P57796 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CABP4P57796 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CABP4P57796 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CABP4P57796 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CABP4P57796 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CABP4P57796 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CABP4P57796 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms