Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RRP1P56182 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP1P56182 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RRP1P56182 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RRP1P56182 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RRP1P56182 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RRP1P56182 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RRP1P56182 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RRP1P56182 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RRP1P56182 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RRP1P56182 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms