Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CASP7P55210 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CASP7P55210 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CASP7P55210 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP7P55210 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP7P55210 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CASP7P55210 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CASP7P55210 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASP7P55210 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASP7P55210 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms