Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EPHB1P54762 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB1P54762 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms