Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CRISP1P54107 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CRISP1P54107 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms