Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BRCA2P51587 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BRCA2P51587 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms