Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DAP3P51398 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DAP3P51398 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DAP3P51398 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DAP3P51398 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DAP3P51398 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
DAP3P51398 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
DAP3P51398 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DAP3P51398 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms