Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB27AP51159 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB27AP51159 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms