Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ETV1P50549 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ETV1P50549 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ETV1P50549 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms