Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRE11P49959 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRE11P49959 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MRE11P49959 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRE11P49959 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRE11P49959 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms