Protein–RNA interactions for Protein: P49914

MTHFS, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFSP49914 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTHFSP49914 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MTHFSP49914 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTHFSP49914 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms