Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
POU3F4P49335 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POU3F4P49335 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms