Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC11A1P49279 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC11A1P49279 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms