Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NESP48681 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
NESP48681 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
NESP48681 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
NESP48681 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NESP48681 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
NESP48681 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NESP48681 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NESP48681 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NESP48681 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
NESP48681 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NESP48681 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NESP48681 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms