Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCAMP43121 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCAMP43121 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCAMP43121 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCAMP43121 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCAMP43121 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCAMP43121 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCAMP43121 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCAMP43121 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCAMP43121 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCAMP43121 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCAMP43121 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCAMP43121 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCAMP43121 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MCAMP43121 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCAMP43121 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms