Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTGIRP43119 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms