Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDF5P43026 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF5P43026 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF5P43026 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF5P43026 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF5P43026 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF5P43026 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDF5P43026 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDF5P43026 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms