Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC1A4P43007 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC1A4P43007 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms