Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PBX1P40424 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PBX1P40424 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PBX1P40424 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PBX1P40424 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PBX1P40424 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PBX1P40424 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms