Protein–RNA interactions for Protein: P40305

IFI27, Interferon alpha-inducible protein 27, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27P40305 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
IFI27P40305 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
IFI27P40305 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFI27P40305 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
IFI27P40305 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IFI27P40305 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IFI27P40305 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IFI27P40305 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms