Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTN2P35609 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTN2P35609 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms