Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RCVRNP35243 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RCVRNP35243 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms