Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDXP35241 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDXP35241 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDXP35241 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDXP35241 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDXP35241 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDXP35241 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDXP35241 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RDXP35241 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDXP35241 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDXP35241 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDXP35241 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDXP35241 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDXP35241 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RDXP35241 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms