Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HLA-FP30511 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-FP30511 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HLA-FP30511 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms