Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MARCKSP29966 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms