Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GCAP28676 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GCAP28676 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCAP28676 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCAP28676 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GCAP28676 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GCAP28676 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GCAP28676 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GCAP28676 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GCAP28676 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GCAP28676 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms