Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLNP26678 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLNP26678 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLNP26678 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLNP26678 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLNP26678 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLNP26678 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLNP26678 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLNP26678 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLNP26678 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLNP26678 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLNP26678 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLNP26678 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PLNP26678 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PLNP26678 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PLNP26678 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms