Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NFKBIAP25963 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKBIAP25963 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms