Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BCL3P20749 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BCL3P20749 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BCL3P20749 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BCL3P20749 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCL3P20749 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCL3P20749 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCL3P20749 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCL3P20749 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BCL3P20749 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms