Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR1D1P20393 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms