Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT15P19012 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT15P19012 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
KRT15P19012 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRT15P19012 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRT15P19012 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms