Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL17P18621 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL17P18621 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL17P18621 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL17P18621 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL17P18621 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL17P18621 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL17P18621 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms