Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDGFRAP16234 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRAP16234 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms