Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNT1P13805 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT1P13805 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms