Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COX4I1P13073 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COX4I1P13073 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms