Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LYL1P12980 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LYL1P12980 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LYL1P12980 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LYL1P12980 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYL1P12980 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYL1P12980 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYL1P12980 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYL1P12980 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LYL1P12980 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms