Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRFP11831 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SRFP11831 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SRFP11831 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRFP11831 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRFP11831 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRFP11831 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRFP11831 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRFP11831 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRFP11831 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRFP11831 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRFP11831 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRFP11831 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRFP11831 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRFP11831 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SRFP11831 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRFP11831 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRFP11831 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms