Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTPRFP10586 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTPRFP10586 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms