Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP3P08254 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP3P08254 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP3P08254 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP3P08254 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP3P08254 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MMP3P08254 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP3P08254 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP3P08254 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms