Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CYBBP04839 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CYBBP04839 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYBBP04839 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYBBP04839 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYBBP04839 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYBBP04839 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CYBBP04839 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYBBP04839 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms