Protein–RNA interactions for Protein: P01762

IGHV3-11, Immunoglobulin heavy variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-11P01762 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
IGHV3-11P01762 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms