Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CBX7O95931 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CBX7O95931 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CBX7O95931 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CBX7O95931 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CBX7O95931 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX7O95931 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CBX7O95931 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CBX7O95931 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms