Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLSTN1O94985 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLSTN1O94985 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms