Protein–RNA interactions for Protein: O94876

TMCC1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC1O94876 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMCC1O94876 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMCC1O94876 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms