Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPM3O75607 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPM3O75607 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPM3O75607 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NPM3O75607 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPM3O75607 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPM3O75607 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NPM3O75607 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPM3O75607 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPM3O75607 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPM3O75607 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms