Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRD4O60885 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRD4O60885 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRD4O60885 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRD4O60885 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRD4O60885 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRD4O60885 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD4O60885 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD4O60885 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD4O60885 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD4O60885 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD4O60885 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRD4O60885 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRD4O60885 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRD4O60885 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRD4O60885 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRD4O60885 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms