Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL3O43909 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL3O43909 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms