Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATP9BO43861 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP9BO43861 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms